activation-induced cytidine deaminase (AICDA) - downstream reference sequence


         .         .         .         .            .         . g.11698
actgtagagaaagagagaagcaaattgagtgaatggcttcaaaa / cgaggttgggggtcgg c.*600

         .         .         .         .         .         .    g.11758
tggggccggagagtcttctaaactgagtggatggctttgtaacatgttggaagaaagtaa    c.*660

         .         .         .         .         .         .    g.11818
attgggaaagagtttttttgggttttttgtttgtttgtttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa    c.*720

         .         .         .         .         .         .    g.11878
aaaaaaaggagaaaagaattctgaccaggaaggaaacgcaaccctggggagagacagaaa    c.*780

         .         .         .         .         .         .    g.11938
tttaaagatgtgaaacaacaaaagaaagaaaagggagggaaaaggaaccttagcagaggg    c.*840

         .         .         .         .         .         .    g.11998
ctctgaatggtgaaacagcagaagaaaaagctgatgtggaggagaaataaagttttcatc    c.*900

         .         .         .         .         .         .    g.12058
agatgaaaactgagagtgattgaacaataagaaaatataagaaatatacgaaactccaaa    c.*960

         .         .         .         .         .         .    g.12118
aaagactgtagagaaagaaagaaaatttaaaaagcgaggaagccccttaccaaaaggatg    c.*1020

         .         .         .         .         .         .    g.12178
cgccgaagctgtctggagagacgaactgaattttcatgcagcccttcccaggctttgaaa    c.*1080

         .         .         .         .         .         .    g.12238
gttctttcgtggttttctacaaaagtattccagcagtaaaaataatcttcaaaaaaaaaa    c.*1140

         .         .         .         .         .         .    g.12298
aaaggaaaaaaaggcggggatatgggggtagaagacagttcaggttccaaatcgagggga    c.*1200

         .         .         .         .         .         .    g.12358
aagaagcaaccctggccccattttctcatttcctcggggccttgtctctgagccattcac    c.*1260

         .         .         .         .         .         .    g.12418
tcttttctctgcttctaatctttaatttcggctccagaggtgaaccagaatccccgccca    c.*1320

         .         .         .         .         .         .    g.12478
cttcttcccctcgagcttccccactaactcattcattccgcatcgcaatcccgaatgcgg    c.*1380

         .         .         .         .         .         .    g.12538
gctgctgcactgcgcctgcgcggaaggccctttcgcacctttgaaggtcatgatggctat    c.*1440

         .         .         .         .         .         .    g.12598
ttgcaccccggcgcggtgcagccgccgcagcccctcgggctcagccttgcggtcctcaca    c.*1500

         .         .         .         .         .         .    g.12658
gaagtagaggcgcgcggtgaagatcctcagactgaggttggggttccctcgcagaaagtc    c.*1560

         .         .         .         .         .         .    g.12718
ggccacatgtcgggcacagtcgtagcaggggctccaggaggtgaaccaggtgacgcggta    c.*1620

         .         .         .         .         .         .    g.12778
gcagcggccagggtctaggtcccagtccgagatgtagcggaggaagagcaattccacgtg    c.*1680

         .         .         .         .         .         .    g.12838
gcagccgttctggagagacagagaggaccacgctaaaattcactgacttttattgcggct    c.*1740

         .         .         .         .         .         .    g.12898
ctggtagccttagtcattgtctcctgcaatgatctttggggatgcttgcagctattgtcc    c.*1800

         .         .         .         .         .         .    g.12958
ttgtgttacagagaggctaagcaacttgctcaaaagagcacaccagtaggtagagctgaa    c.*1860

         .         .         .         .         .         .    g.13018
cccttggcagcactagtcctgcagagtgaaggaaggctatgggtttttgtggaatgagga    c.*1920

         .         .         .         .         .         .    g.13078
agacgaagtgcgctgagttgggaggaagcagcatcacactacctcaccgaagatttaatt    c.*1980

         .         .         .         .         .         .    g.13138
tgtgtttatgaagttgctttttgcaccttttgagaaggaaaatggctagaagtgcctgtt    c.*2040

         .         .         .         .         .         .    g.13198
gatgtaacattgtggaaatatacctggaccactaggtggaggcaggacagtttatgagga    c.*2100

         .         .         .         .         .         .    g.13258
ccatttgggaggatctgaaaaggggaaatagattttggtaaagcagacagatgggtattg    c.*2160

         .         .         .         .         .         .    g.13318
taagagaagtaataggcactgccatgagaagtaaatgaaagtgcttgataaaatcaaagc    c.*2220

         .         .         .         .         .         .    g.13378
cttctgaaatagaatgtgtcatgtcaccgaataggaaggagattgggatgtattcaatac    c.*2280

         .         .         .         .         .         .    g.13438
aaatgtaggcaaagaaaattgcatggtaatataaccatcaaacaacgagccagacgatga    c.*2340

         .         .         .         .         .         .    g.13498
ccttccaccccacggatgcttccctgagattccaccaagcccagacgtcacagcgtgtta    c.*2400

         .         .         .         .         .         .    g.13558
ggagagaggagatacccgtgggcagaagtttatgtaaacccatctggattttggtgaaga    c.*2460

         .         .         .         .         .         .    g.13618
agtctcttggaaatgtaattctctcgggtagccgaaagatcaatttaattaatcatcagc    c.*2520

         .         .         .         .         .         .    g.13678
cgaggcttctctgagttttctggggatcaccatgttgaatgtattcactggcctacgacc    c.*2580

         .         .         .         .         .         .    g.13738
catgtgagtaggagggaaaagaaatcatttggaagacagaattgagccaccgttaatttt    c.*2640

         .         .         .         .         .         .    g.13798
ttcccaaattcttcttccttaattttcaaaaatgcttaagacacaatttgtttttcacat    c.*2700

         .         .         .         .         .         .    g.13858
ttaaaatttttgcttggacaagctgataatattctcccatataaaaatgcttttagctta    c.*2760

         .         .         .         .         .         .    g.13918
attaatctcaaaggcaattcagatgctgaggaaagctggtaaacagtttgggagcagttg    c.*2820

         .         .         .         .         .         .    g.13978
ttcttggcactgaaggaaggagtggtattagggtgcccagcattactggggaggaattaa    c.*2880

         .         .         .         .         .         .    g.14038
atcacatattttgggccatgtctaatatgggtgcatggacatggaaaaagaaataaaaaa    c.*2940

         .         .         .         .         .         .    g.14098
aaggatttgaggaatgtgatagagacacaaatgccaaaaaaggatggaagtaataccatc    c.*3000

         .         .         .         .         .         .    g.14158
agcaggtggctctaaaagcactcacagttgaccattaaactgcttgcaaagccgacttta    c.*3060

         .         .         .         .         .         .    g.14218
attgataccttattgcgaagataaccaaagtccagtgaaaaggatgtagcactgtcacgc    c.*3120

         .         .         .         .         .         .    g.14278
ctcttcactacgtagcacaggtaggtctcacgccgacccttagcccagcggacatttttg    c.*3180

         .         .         .         .         .         .    g.14338
aattggtaaagaaacttcctccggttcatcaagaggctgtgggtgagaggagggagagaa    c.*3240

         .         .         .         .         .         .    g.14398
aatgcaagagtacagtttataatctggtcactctggattttccttcagctttttaaggaa    c.*3300

         .         .         .         .         .         .    g.14458
gtcattacttgggctaaaccaaagaagatgctctgacttcctctgctggctgcctgagcc    c.*3360

         .         .         .         .         .         .    g.14518
ctcctgagccctgctgagcctggaatccatcataaactccttttcctgcttatatttaag    c.*3420

         .         .         .         .         .         .    g.14578
gccaattgagagatactcatcaaggaccccaaacccttacccacaagacagtcacctcct    c.*3480

         .         .         .         .         .         .    g.14638
gccactgtcttctagatgctgatgacttgggattacaattaaatttgttcttcaacaaga    c.*3540

         .         .         .         .         .         .    g.14698
aaacgaaacaaaaaataaaataaacttgttcctcagtcccataattgtatattcagattt    c.*3600

         .         .         .         .         .         .    g.14758
cccctccagtctttacctaagtgtccaacttgtacctcaaactcaaaatgatcaaaacaa    c.*3660

         .         .         .         .         .         .    g.14818
tattcctcaactgccccctgtcctaaactgccactcctcccgactttgccacctcaggta    c.*3720

         .         .         .         .         .         .    g.14878
agcagcctagcagcctggaaccatccttgactcatttcttattcctcagtcctcatattt    c.*3780

         .         .         .         .         .         .    g.14938
aattaatcatctaaatgtgttgattcaaaccccccaatatttcttgaatttgtaccttcc    c.*3840

         .         .         .         .         .         .    g.14998
ctgtttgctcttctctgcttcggtccaagccctcatcttcttcctccttatctgttgtgc    c.*3900

         .         .         .         .         .         .    g.15058
tggccttttaaccggtctgtctgcctccagtccctccaaaataacattccccacactgtc    c.*3960

         .         .         .         .         .         .    g.15118
accaccatgatctcacaaaaaccaggtgcaccatgccattcccatgctgaagaccccctg    c.*4020

         .         .         .         .         .         .    g.15178
atggttctcttctgcctgcagaataaactccaaactctttaatgtggtgtttaggccact    c.*4080

         .         .         .         .         .         .    g.15238
ttttacagttggatcttgatctaaatttctttttttaaatttttttttttttgttacggt    c.*4140

         .         .         .         .         .         .    g.15298
ctcactttgtcgcccaggctgaagtatactggcatgatcttggcttactgtagcctcaac    c.*4200

         .         .         .         .         .         .    g.15358
ctcccaggctcaggcagatctgccaggctccgcggatcctcctgcctcagcctcctgagt    c.*4260

         .         .         .         .         .         .    g.15418
agctgggattacaggcgcccaccatcatgcccaggtaatgtttgtatttttaatagagac    c.*4320

         .         .         .         .         .         .    g.15478
ggggtttcaccatcttggccaggctggccttggactcctgacctcgggtgttctgcccgc    c.*4380

         .         .         .         .         .         .    g.15538
cttggcttcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccactgcaccggcctattttttaa    c.*4440

         .         .         .         .         .         .    g.15598
tgtataagagcaatacctggctgggcgcagtggctcacacctgttttttaatgtataaga    c.*4500

         .         .         .         .         .         .    g.15658
gcaatacttggccgggcgcagtggcctacatctgtaatcccagcactttgggaggctgag    c.*4560

         .         .         .         .         .         .    g.15718
gcaggtggatcctctgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggtgaaacccc    c.*4620

         .         .         .         .         .         .    g.15778
atctctactaaaaatacaaacattagccgagtgtggtggtgggcgcctgtaatcccatct    c.*4680

         .         .         .         .         .         .    g.15838
acccgggaggctgaggcgacagctttgcttgaacccaggaggtggaggttgcagtgagct    c.*4740

         .         .         .         .         .         .    g.15898
atggtcatgccattccactccagcatgggcaacaagaccaaaactccatctcaaaaaaaa    c.*4800

         .         .         .         .         .         .    g.15958
aaaaaaaaaaaaaaaaagaaagagtaatacttgatcattgtcaaacttgaatactatgga    c.*4860

         .         .         .         .         .         .    g.16018
aaaatagaagagctctaaattttaaaatattaaagattttttaaatctcaaatatcatag    c.*4920

         .         .         .         .         .         .    g.16078
tgtctaataataataattagacttagtgtctaatgacaatgactgttaagattcttgtgt    c.*4980

         .         .         .         .         .         .    g.16138
ttattcctctagtctttctacaggcacatatttacatgatttggattatactgattgcat    c.*5040

         .         .         .         .         .         .    g.16198
gtgtgattttgtactctgctgcttttttaactagtcaaaatgatctaaatatcttgctat    c.*5100

         .         .         .         .         .         .    g.16258
gttgttcccacataatgactgatttctcctcctctttgttttctggctcctagcacagtg    c.*5160

         .         .         .         .         .         .    g.16318
tcttgcatatcataagcactaatttgaatagcatttgtggaaatactctggtaacccaag    c.*5220

         .         .         .         .         .         .    g.16378
tttccttaaagaaatcaagagtccccattgcagctgcagacagcaacacaagctgtacag    c.*5280

         .         .         .         .         .         .    g.16438
catggttgatatgaaagcacaagtgatgcctggattttgtccctagtcttttccagaaat    c.*5340

         .         .         .         .         .         .    g.16498
gcatttatccaatttgtggagctagtgctgtcacctaatggtacggggcagaagtgcaga    c.*5400

         .         .         .         .         .         .    g.16558
gaatttgcgaagtaaagggctcaggaatttgaataacgtttgctggcaagagaattgaaa    c.*5460

         .         .         .         .         .         .    g.16618
gttttcttacacattattttttcttacattgaggtataatttacatacagtaaactccac    c.*5520

         .         .         .         .         .         .    g.16678
ccatttaagatgcataattctacgaatatttttggatgtaaacaccccaaactgctacca    c.*5580

         .         .         .         .         .         .    g.16738
cagtcaggatacagaacctgaatcaccaccctcaccccaccagagcttcttccctctttg    c.*5640

         .         .         .         .         .         .    g.16798
cagtccttcccctccccacaggacaaccactgatttgctttctttttttcccatttttgt    c.*5700

         .         .         .         .         .         .    g.16858
ggagaatggagtttcactgtgttgcccaggctggtcttgaactcctgagttctagcaatc    c.*5760

         .         .         .         .         .         .    g.16918
ttcccacgtggcctctcaaagtgctgggattacaggtgtgagcctctatgcctgccctga    c.*5820

         .         .         .         .         .         .    g.16978
tttgctttctgtaactataagttactttcattttctagaatttcgtatggcatacattat    c.*5880

         .         .         .         .         .         .    g.17038
ctcctccttcatgtctgactctttcatttagcgtcatgactttgggattcatccccaagt    c.*5940

         .         .         .         .         .         .    g.17098
agcttctttgtactgcagggtggtattccattgcatggatatagcacattttgtttattt    c.*6000

         .         .         .         .         .         .    g.17158
gttcacttgttgatggatatttggatagtctctactttggggttttgtgaataaaggtac    c.*6060

         .         .         .         .         .         .    g.17218
tatgaacattcacgtaccagtctttgtgtggatatacattgagaattgatattttaataa    c.*6120

         .         .         .         .         .         .    g.17278
tgtagtgcaggtgacagaccctgactttaaaagttaaataccaaaatatcagcctaacta    c.*6180

         .         .         .         .         .         .    g.17338
agtagctcatctaggacaacagctctttgtagttgtttccatttatttttaatttttctt    c.*6240

         .         .         .         .         .         .    g.17398
cttatttttttgaggcaaggtctggtcctgtcacccaggctggagtgcagtggcgcaagc    c.*6300

         .         .         .         .         .         .    g.17458
actgctcagtgcagccttgacctcctgggctccaacgattctcctgcctcagccccctag    c.*6360

         .         .         .         .         .         .    g.17518
tagctgggaccacaggcacatgccaccatgcccggctaatttttgttatagaaacagcgt    c.*6420

         .         .         .         .         .         .    g.17578
tttgccatgttgctcaggctggtcttgaactccagggctcaagcgatccacccacctcag    c.*6480

         .         .         .         .         .         .    g.17638
cctcccagagtgctgggattacaggcgtgagccaccacacctggctgtctgtttcacttt    c.*6540

         .         .         .         .         .         .    g.17698
aaatgtctcccctcacgtacatgaagcttactggaaagcactttaaactttaggcagcaa    c.*6600

         .         .         .         .         .         .    g.17758
actagatttattgccagtatacacattacataaggtaaaaattagccatattattttaaa    c.*6660

         .         .         .         .         .         .    g.17818
atttaaaatgcatattttaatctaaatggatcctaggccagatgcagtggctcatgactg    c.*6720

         .         .         .         .         .         .    g.17878
tatcccaacactttgggaggccaaggcaggaggattgcttgagcccaggagttcaagact    c.*6780

         .         .         .         .         .         .    g.17938
gcagaaagctatgattgcaccactgcactccagcctgggtaacagggtgagattgtcttt    c.*6840

         .         .         .         .         .         .    g.17998
taaaaaatcaaaaacataaaaaacataaaatgaatactaaaaaagatccaataataatta    c.*6900

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gctttattttaaaaggataataatttttatggtaattaccatagtaccaaccaccattac    c.*6960

         .         .         .         .         .         .    g.18118
tattactatattagcatataataaccctttgtatatataagctcaacacataataggtgc    c.*7020

         .         .         .         .         .         .    g.18178
ttaataagtacagaagaaaagaaattctctctttgaggcccagtgttaaacagattaagc    c.*7080

         .         .         .         .         .         .    g.18238
atcatctcttaccaataaatccctcttatattaacttaccctcctgggctgtgtagatga    c.*7140

         .         .         .         .         .         .    g.18298
gaaaggcagaggaatctacatctttttacatgcaccttggttggcggggtgtgtgtttgt    c.*7200

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gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggagagagagagagcctt    c.*7260

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atcataaggaagaaaaagtgtcctggaagtatagataagaaggatgtggcatagataaag    c.*7320

         .         .         .         .         .         .    g.18478
gactttgggtggatttttgggtcctactctacatgaaaatacaataagcctacactgttt    c.*7380

         .         .         .         .         .         .    g.18538
ctgtcacatgttaccagtcagagtgaaatgaattgcgtgatcctgacctgctagttaact    c.*7440

         .         .         .         .         .         .    g.18598
ttgttgatccattacttcccttctctggttaggggcctgtttccagctccctgttctcgt    c.*7500

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catttctgtcctgagtaggaaggactttaccgagggagtgtttcaggcttgcaggctgac    c.*7560

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agctgctctggacagctgtgctccctgaggcagaaccctagctgcatccccagccgtgca    c.*7620

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aaccagaaacaagcgggttaaaaataatcctgaccaagtcattttgccatcactaatgag    c.*7680

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ctctacagatactgtcctccttaatgataatatatttcccttctgtcctgttgaatttca    c.*7740

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tcttttctccttttctgtctttctctgaatttcaactgctgattttacctttgctttcca    c.*7800

         .         .         .         .         .         .    g.18958
ttttactttgaacaagtatttccaatggacccttcacaaggacctatagctcagacttgt    c.*7860

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tttcaaaatctcagtgtaaactgaggagacatttgacattgtctgacctcaagaaaattt    c.*7920

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tctgaagaacattaaatcctccattaaaaatctttattctgtatattggatgtgatggct    c.*7980

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catgtctataattccagcactttaggaggcccaggcaggaggatcgcttgggccaggact    c.*8040

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tagagaccagcctcggctgggctaagaccctgtctctacaaaaaaatatatttttaaaaa    c.*8100

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atctttattctgtaatgtaagttctttataaaggagttaaattgaggtaaagtataagga    c.*8160

         .         .         .         .         .         .    g.19318
ttaggtgttattctcatacatccatagtaatcataaatgtaggaatagaataagttctat    c.*8220

         .         .         .         .         .         .    g.19378
gacaataacctatcaaaaactgcacataaagacattatgaggaccttaaccaaattcaca    c.*8280

         .         .         .         .         .         .    g.19438
cctaagaggtaagttaagctacgtctgaacaaatggaaagattagttaatagtaaaagtg    c.*8340

         .         .         .         .         .         .    g.19498
ccattaactgcctaacaattgggcctttaacattaaataacttgcttgaatgaatttgtc    c.*8400

         .         .         .         .         .         .    g.19558
tccttataatggacacaatcatagtgactttcaagcaattaatttagaatgcttggcatt    c.*8460

         .         .         .         .         .         .    g.19618
tctaaaattacaaattttcttactatagctaaattatttcagtaacgcctccctaggaaa    c.*8520

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gtgtgtcttcaagttgttttactgttgaatatttacaaaattattacgaaaattagcact    c.*8580

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accgtttttagtacagtactgctattaccttttcatgatttgagtctctaaagatttgct    c.*8640

         .         .         .         .         .         .    g.19798
atgttaatattattaccataaattagtttcaaccatggtacaaatctcaggacgaatcag    c.*8700

         .         .         .         .         .         .    g.19858
tacattgtacgcactacttcttttgccacatgaaaaagagggaaatcaagagaagtctga    c.*8760

         .         .         .         .         .         .    g.19918
aacagaaagaattgggctgacagcgtataagatctgaatagaagaaaaggagacagatca    c.*8820

         .         .         .         .         .         .    g.19978
aaaaatatatatgcatattgatcaagctgatcttatcagtcagacagttacatgagagaa    c.*8880

         .         .         .         .         .         .    g.20038
agggatagctaccagtctcattactcagatttgctctgagaggaaggccagtgcaatcac    c.*8940

         .         .         .         .         .         .    g.20098
ccacgagaagactgcctctttacctgtccatagtggtgtccagagtgtcttcttgcctcc    c.*9000

         .         .         .         .         .         .    g.20158
ctgcaagtctcaggccagaaaaatctcacttcaattaatgatggttctctgtcttagtct    c.*9060

         .         .         .         .         .         .    g.20218
gacagtgcattggcccttcacattcaaatttgagcttgcccttttgggctcctcccctga    c.*9120

         .         .         .         .         .         .    g.20278
cagcatcacccccaccaggtaccccaacggccttgctcctgatttggatccagtgaagat    c.*9180

         .         .         .         .         .         .    g.20338
gggtgggtggggctgtcataggcagagtcacacaggttaaaccattgagggcagctctgc    c.*9240

         .         .         .         .         .         .    g.20398
tttaatgtttaggttcctttggggctgctgctctaaaagcccagtccatgctccatagct    c.*9300

         .         .         .         .         .         .    g.20458
agcaaagatcaggaggcagtaacagtagacacttcaattataatcatgataacacaaaat    c.*9360

         .         .         .         .         .         .    g.20518
aaaagcacaatgagaatagtaatatttatgtaaataccttaaagagcatttaaatagctt    c.*9420

         .         .         .         .         .         .    g.20578
cttgggttattgtgttgaagagcctcagatagcctctaattcccccatattcccacagtc    c.*9480

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tctctgaacctcagtacagacaggcactagcagctcctgctttgcagttaagcaaatgaa    c.*9540

         .         .         .         .         .         .    g.20698
ctcagttatatagaatttagaacacaaaaattttgcctcccaaaccatggatttttttct    c.*9600

         .         .         .         .         .         .    g.20758
ttctgattgcattacaagaattgcttgaagactagatatttacaccaaagagtgattttt    c.*9660

         .         .         .         .         .         .    g.20818
gcatgagccatcttttttagaaaaaaaaaaaatccttaatttggagtcagaagcagcagc    c.*9720

         .         .         .         .         .         .    g.20878
agtcccccaaaatacaaaaatgcttgtttcaccagacagattcagtgtctaactggctgc    c.*9780

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actgaatttggaaaacaggctaagatcttcaaataaaagactttaattttgtgctctcat    c.*9840

         .         .         .         .         .         .    g.20998
agaacttggtctattaaagattttatttctctctcctactgtagcccatatgcattctat    c.*9900

         .         .         .         .         .         .    g.21058
ttattcactgagtagatacttcatgcctactgttaatggaaactatgccaggtgctaggg    c.*9960

         .         .         .         .         .         .    g.21118
atgcaatgctaagcaatgcagctagggtctctgctctcttcctgcctcaagcctttgata    c.*10020

         .         .         .         .         .              g.21170
ccatctata                                                       c.*10072


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