activation-induced cytidine deaminase (AICDA) - 5747 nt intron 03 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.5907
ctgtgggtgagaggagggagagaaaatgcaagagtacagtttataatctggtcactctgg  c.535+60

         .         .         .         .         .         .  g.5967
attttccttcagctttttaaggaagtcattacttgggctaaaccaaagaagatgctctga  c.535+120

         .         .         .         .         .         .  g.6027
cttcctctgctggctgcctgagccctcctgagccctgctgagcctggaatccatcataaa  c.535+180

         .         .         .         .         .         .  g.6087
ctccttttcctgcttatatttaaggccaattgagagatactcatcaaggaccccaaaccc  c.535+240

         .         .         .         .         .         .  g.6147
ttacccacaagacagtcacctcctgccactgtcttctagatgctgatgacttgggattac  c.535+300

         .         .         .         .         .         .  g.6207
aattaaatttgttcttcaacaagaaaacgaaacaaaaaataaaataaacttgttcctcag  c.535+360

         .         .         .         .         .         .  g.6267
tcccataattgtatattcagatttcccctccagtctttacctaagtgtccaacttgtacc  c.535+420

         .         .         .         .         .         .  g.6327
tcaaactcaaaatgatcaaaacaatattcctcaactgccccctgtcctaaactgccactc  c.535+480

         .         .         .         .         .         .  g.6387
ctcccgactttgccacctcaggtaagcagcctagcagcctggaaccatccttgactcatt  c.535+540

         .         .         .         .         .         .  g.6447
tcttattcctcagtcctcatatttaattaatcatctaaatgtgttgattcaaacccccca  c.535+600

         .         .         .         .         .         .  g.6507
atatttcttgaatttgtaccttccctgtttgctcttctctgcttcggtccaagccctcat  c.535+660

         .         .         .         .         .         .  g.6567
cttcttcctccttatctgttgtgctggccttttaaccggtctgtctgcctccagtccctc  c.535+720

         .         .         .         .         .         .  g.6627
caaaataacattccccacactgtcaccaccatgatctcacaaaaaccaggtgcaccatgc  c.535+780

         .         .         .         .         .         .  g.6687
cattcccatgctgaagaccccctgatggttctcttctgcctgcagaataaactccaaact  c.535+840

         .         .         .         .         .         .  g.6747
ctttaatgtggtgtttaggccactttttacagttggatcttgatctaaatttcttttttt  c.535+900

         .         .         .         .         .         .  g.6807
aaatttttttttttttgttacggtctcactttgtcgcccaggctgaagtatactggcatg  c.535+960

         .         .         .         .         .         .  g.6867
atcttggcttactgtagcctcaacctcccaggctcaggcagatctgccaggctccgcgga  c.535+1020

         .         .         .         .         .         .  g.6927
tcctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcgcccaccatcatgcccaggt  c.535+1080

         .         .         .         .         .         .  g.6987
aatgtttgtatttttaatagagacggggtttcaccatcttggccaggctggccttggact  c.535+1140

         .         .         .         .         .         .  g.7047
cctgacctcgggtgttctgcccgccttggcttcccaaagtgctgggattacaggcgtgag  c.535+1200

         .         .         .         .         .         .  g.7107
ccactgcaccggcctattttttaatgtataagagcaatacctggctgggcgcagtggctc  c.535+1260

         .         .         .         .         .         .  g.7167
acacctgttttttaatgtataagagcaatacttggccgggcgcagtggcctacatctgta  c.535+1320

         .         .         .         .         .         .  g.7227
atcccagcactttgggaggctgaggcaggtggatcctctgaggtcaggagtttgagacca  c.535+1380

         .         .         .         .         .         .  g.7287
gcctggccaacatggtgaaaccccatctctactaaaaatacaaacattagccgagtgtgg  c.535+1440

         .         .         .         .         .         .  g.7347
tggtgggcgcctgtaatcccatctacccgggaggctgaggcgacagctttgcttgaaccc  c.535+1500

         .         .         .         .         .         .  g.7407
aggaggtggaggttgcagtgagctatggtcatgccattccactccagcatgggcaacaag  c.535+1560

         .         .         .         .         .         .  g.7467
accaaaactccatctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaagagtaatacttgatc  c.535+1620

         .         .         .         .         .         .  g.7527
attgtcaaacttgaatactatggaaaaatagaagagctctaaattttaaaatattaaaga  c.535+1680

         .         .         .         .         .         .  g.7587
ttttttaaatctcaaatatcatagtgtctaataataataattagacttagtgtctaatga  c.535+1740

         .         .         .         .         .         .  g.7647
caatgactgttaagattcttgtgtttattcctctagtctttctacaggcacatatttaca  c.535+1800

         .         .         .         .         .         .  g.7707
tgatttggattatactgattgcatgtgtgattttgtactctgctgcttttttaactagtc  c.535+1860

         .         .         .         .         .         .  g.7767
aaaatgatctaaatatcttgctatgttgttcccacataatgactgatttctcctcctctt  c.535+1920

         .         .         .         .         .         .  g.7827
tgttttctggctcctagcacagtgtcttgcatatcataagcactaatttgaatagcattt  c.535+1980

         .         .         .         .         .         .  g.7887
gtggaaatactctggtaacccaagtttccttaaagaaatcaagagtccccattgcagctg  c.535+2040

         .         .         .         .         .         .  g.7947
cagacagcaacacaagctgtacagcatggttgatatgaaagcacaagtgatgcctggatt  c.535+2100

         .         .         .         .         .         .  g.8007
ttgtccctagtcttttccagaaatgcatttatccaatttgtggagctagtgctgtcacct  c.535+2160

         .         .         .         .         .         .  g.8067
aatggtacggggcagaagtgcagagaatttgcgaagtaaagggctcaggaatttgaataa  c.535+2220

         .         .         .         .         .         .  g.8127
cgtttgctggcaagagaattgaaagttttcttacacattattttttcttacattgaggta  c.535+2280

         .         .         .         .         .         .  g.8187
taatttacatacagtaaactccacccatttaagatgcataattctacgaatatttttgga  c.535+2340

         .         .         .         .         .         .  g.8247
tgtaaacaccccaaactgctaccacagtcaggatacagaacctgaatcaccaccctcacc  c.535+2400

         .         .         .         .         .         .  g.8307
ccaccagagcttcttccctctttgcagtccttcccctccccacaggacaaccactgattt  c.535+2460

         .         .         .         .         .         .  g.8367
gctttctttttttcccatttttgtggagaatggagtttcactgtgttgcccaggctggtc  c.535+2520

         .         .         .         .         .         .  g.8427
ttgaactcctgagttctagcaatcttcccacgtggcctctcaaagtgctgggattacagg  c.535+2580

         .         .         .         .         .         .  g.8487
tgtgagcctctatgcctgccctgatttgctttctgtaactataagttactttcattttct  c.535+2640

         .         .         .         .         .         .  g.8547
agaatttcgtatggcatacattatctcctccttcatgtctgactctttcatttagcgtca  c.535+2700

         .         .         .         .         .         .  g.8607
tgactttgggattcatccccaagtagcttctttgtactgcagggtggtattccattgcat  c.535+2760

         .         .         .         .         .         .  g.8667
ggatatagcacattttgtttatttgttcacttgttgatggatatttggatagtctctact  c.535+2820

         .         .         .         .         .      g.8721
ttggggttttgtgaataaaggtactatgaacattcacgtaccagtctttgtgtg  c.535+2874

--------------------- middle of intron ---------------------
          .         .         .         .         .           g.8774
       gatatacattgagaattgatattttaataatgtagtgcaggtgacagaccctg  c.536-2821

.         .         .         .         .         .           g.8834
actttaaaagttaaataccaaaatatcagcctaactaagtagctcatctaggacaacagc  c.536-2761

.         .         .         .         .         .           g.8894
tctttgtagttgtttccatttatttttaatttttcttcttatttttttgaggcaaggtct  c.536-2701

.         .         .         .         .         .           g.8954
ggtcctgtcacccaggctggagtgcagtggcgcaagcactgctcagtgcagccttgacct  c.536-2641

.         .         .         .         .         .           g.9014
cctgggctccaacgattctcctgcctcagccccctagtagctgggaccacaggcacatgc  c.536-2581

.         .         .         .         .         .           g.9074
caccatgcccggctaatttttgttatagaaacagcgttttgccatgttgctcaggctggt  c.536-2521

.         .         .         .         .         .           g.9134
cttgaactccagggctcaagcgatccacccacctcagcctcccagagtgctgggattaca  c.536-2461

.         .         .         .         .         .           g.9194
ggcgtgagccaccacacctggctgtctgtttcactttaaatgtctcccctcacgtacatg  c.536-2401

.         .         .         .         .         .           g.9254
aagcttactggaaagcactttaaactttaggcagcaaactagatttattgccagtataca  c.536-2341

.         .         .         .         .         .           g.9314
cattacataaggtaaaaattagccatattattttaaaatttaaaatgcatattttaatct  c.536-2281

.         .         .         .         .         .           g.9374
aaatggatcctaggccagatgcagtggctcatgactgtatcccaacactttgggaggcca  c.536-2221

.         .         .         .         .         .           g.9434
aggcaggaggattgcttgagcccaggagttcaagactgcagaaagctatgattgcaccac  c.536-2161

.         .         .         .         .         .           g.9494
tgcactccagcctgggtaacagggtgagattgtcttttaaaaaatcaaaaacataaaaaa  c.536-2101

.         .         .         .         .         .           g.9554
cataaaatgaatactaaaaaagatccaataataattagctttattttaaaaggataataa  c.536-2041

.         .         .         .         .         .           g.9614
tttttatggtaattaccatagtaccaaccaccattactattactatattagcatataata  c.536-1981

.         .         .         .         .         .           g.9674
accctttgtatatataagctcaacacataataggtgcttaataagtacagaagaaaagaa  c.536-1921

.         .         .         .         .         .           g.9734
attctctctttgaggcccagtgttaaacagattaagcatcatctcttaccaataaatccc  c.536-1861

.         .         .         .         .         .           g.9794
tcttatattaacttaccctcctgggctgtgtagatgagaaaggcagaggaatctacatct  c.536-1801

.         .         .         .         .         .           g.9854
ttttacatgcaccttggttggcggggtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg  c.536-1741

.         .         .         .         .         .           g.9914
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtggagagagagagagccttatcataaggaagaaaaagtgtcc  c.536-1681

.         .         .         .         .         .           g.9974
tggaagtatagataagaaggatgtggcatagataaaggactttgggtggatttttgggtc  c.536-1621

.         .         .         .         .         .           g.10034
ctactctacatgaaaatacaataagcctacactgtttctgtcacatgttaccagtcagag  c.536-1561

.         .         .         .         .         .           g.10094
tgaaatgaattgcgtgatcctgacctgctagttaactttgttgatccattacttcccttc  c.536-1501

.         .         .         .         .         .           g.10154
tctggttaggggcctgtttccagctccctgttctcgtcatttctgtcctgagtaggaagg  c.536-1441

.         .         .         .         .         .           g.10214
actttaccgagggagtgtttcaggcttgcaggctgacagctgctctggacagctgtgctc  c.536-1381

.         .         .         .         .         .           g.10274
cctgaggcagaaccctagctgcatccccagccgtgcaaaccagaaacaagcgggttaaaa  c.536-1321

.         .         .         .         .         .           g.10334
ataatcctgaccaagtcattttgccatcactaatgagctctacagatactgtcctcctta  c.536-1261

.         .         .         .         .         .           g.10394
atgataatatatttcccttctgtcctgttgaatttcatcttttctccttttctgtctttc  c.536-1201

.         .         .         .         .         .           g.10454
tctgaatttcaactgctgattttacctttgctttccattttactttgaacaagtatttcc  c.536-1141

.         .         .         .         .         .           g.10514
aatggacccttcacaaggacctatagctcagacttgttttcaaaatctcagtgtaaactg  c.536-1081

.         .         .         .         .         .           g.10574
aggagacatttgacattgtctgacctcaagaaaattttctgaagaacattaaatcctcca  c.536-1021

.         .         .         .         .         .           g.10634
ttaaaaatctttattctgtatattggatgtgatggctcatgtctataattccagcacttt  c.536-961

.         .         .         .         .         .           g.10694
aggaggcccaggcaggaggatcgcttgggccaggacttagagaccagcctcggctgggct  c.536-901

.         .         .         .         .         .           g.10754
aagaccctgtctctacaaaaaaatatatttttaaaaaatctttattctgtaatgtaagtt  c.536-841

.         .         .         .         .         .           g.10814
ctttataaaggagttaaattgaggtaaagtataaggattaggtgttattctcatacatcc  c.536-781

.         .         .         .         .         .           g.10874
atagtaatcataaatgtaggaatagaataagttctatgacaataacctatcaaaaactgc  c.536-721

.         .         .         .         .         .           g.10934
acataaagacattatgaggaccttaaccaaattcacacctaagaggtaagttaagctacg  c.536-661

.         .         .         .         .         .           g.10994
tctgaacaaatggaaagattagttaatagtaaaagtgccattaactgcctaacaattggg  c.536-601

.         .         .         .         .         .           g.11054
cctttaacattaaataacttgcttgaatgaatttgtctccttataatggacacaatcata  c.536-541

.         .         .         .         .         .           g.11114
gtgactttcaagcaattaatttagaatgcttggcatttctaaaattacaaattttcttac  c.536-481

.         .         .         .         .         .           g.11174
tatagctaaattatttcagtaacgcctccctaggaaagtgtgtcttcaagttgttttact  c.536-421

.         .         .         .         .         .           g.11234
gttgaatatttacaaaattattacgaaaattagcactaccgtttttagtacagtactgct  c.536-361

.         .         .         .         .         .           g.11294
attaccttttcatgatttgagtctctaaagatttgctatgttaatattattaccataaat  c.536-301

.         .         .         .         .         .           g.11354
tagtttcaaccatggtacaaatctcaggacgaatcagtacattgtacgcactacttcttt  c.536-241

.         .         .         .         .         .           g.11414
tgccacatgaaaaagagggaaatcaagagaagtctgaaacagaaagaattgggctgacag  c.536-181

.         .         .         .         .         .           g.11474
cgtataagatctgaatagaagaaaaggagacagatcaaaaaatatatatgcatattgatc  c.536-121

.         .         .         .         .         .           g.11534
aagctgatcttatcagtcagacagttacatgagagaaagggatagctaccagtctcatta  c.536-61

.         .         .         .         .         .           g.11594
ctcagatttgctctgagaggaaggccagtgcaatcacccacgagaagactgcctctttac  c.536-1


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