Hermansky-Pudlak syndrome 3 (HPS3) - 4111 nt intron 16 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.39460
gtaaaatgattttttttttgcttgattataaacttaagtttcagttttaaatttggtgaa  c.2887+60

         .         .         .         .         .         .  g.39520
gccttcttaagtattttcatgtgattctcaagtgaaaccgagggcctttcagaaccatct  c.2887+120

         .         .         .         .         .         .  g.39580
ggggagcttattttcagcattcacgtaccctccccttgacatttgatattgatttatctc  c.2887+180

         .         .         .         .         .         .  g.39640
ctagtcacagaactgatgttcttttaacttaatcctttcaaacacttaacaaattatcac  c.2887+240

         .         .         .         .         .         .  g.39700
agtcatagaaaatgacagcatcagtgttttaaaatgtgagtagtcattaaggcaattaca  c.2887+300

         .         .         .         .         .         .  g.39760
tcttttatcaatgatcagagtacttaatttacttcatgtaggaagttaagatcattacta  c.2887+360

         .         .         .         .         .         .  g.39820
ttaaacataattataagcaagtattgatgaataacaacctcaaggatttaaaagttgagt  c.2887+420

         .         .         .         .         .         .  g.39880
atctaaattgtaccgtattttacagcatagtagttatttgaattttcataattcataatc  c.2887+480

         .         .         .         .         .         .  g.39940
ataaatcttggtagatatgtaatctgtttctatactgctgtgtgttaatataattagttg  c.2887+540

         .         .         .         .         .         .  g.40000
ttttcccaatgacaaagggtatgggtatatcaattgcagagcacataaaatattagaaat  c.2887+600

         .         .         .         .         .         .  g.40060
tgacagtgttgaaattgtgttttccagccaagacagttgatttttaaaatgtaaggccga  c.2887+660

         .         .         .         .         .         .  g.40120
gtcagtggccactggagattatttttctgaagatccccctttaattaaagctgtatgctt  c.2887+720

         .         .         .         .         .         .  g.40180
gtgattgggaagggaaagggggaactttattctctgtcctacccgtctccctgattgctt  c.2887+780

         .         .         .         .         .         .  g.40240
taggttttcagaagatggaagtgtcagatgtctgattactttgccccacttgcatacact  c.2887+840

         .         .         .         .         .         .  g.40300
ttacataatttatcactgactgtttgtgttagtggagcactttccagtacagacatccca  c.2887+900

         .         .         .         .         .         .  g.40360
catctttacacctcagcatcatcattatcttaatcagaagactctttcttcatccttttc  c.2887+960

         .         .         .         .         .         .  g.40420
tgatccacatccacacactccaccccaactcacccataatcattcctccaaatgttgcat  c.2887+1020

         .         .         .         .         .         .  g.40480
ttttctctgtcttcaaaatatatttgtgtgcatacgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatggc  c.2887+1080

         .         .         .         .         .         .  g.40540
taatgagactaagtgccatgtgtgatttacctttattagactgtaatacctcaagagctg  c.2887+1140

         .         .         .         .         .         .  g.40600
gcatagtgttttattcattttttcaagctacacattcctcaccagcaatatgcctctcct  c.2887+1200

         .         .         .         .         .         .  g.40660
ataggaagcattctgtaactgttcattgattagaaagggagacagctgaagaactttagg  c.2887+1260

         .         .         .         .         .         .  g.40720
ttcgtttcacagaagggtgttttcttaacagttgtacactgaaaagagccctgtactggg  c.2887+1320

         .         .         .         .         .         .  g.40780
atctggagaattggaactgagttccaggtttgccacttactaagtgtccgagagcaaccc  c.2887+1380

         .         .         .         .         .         .  g.40840
agttttctaatgtcgtgagactaaatgagaagttcaggactgaatcaaaagttaaatgtt  c.2887+1440

         .         .         .         .         .         .  g.40900
aggcaaaattgcaagagggagaggttggagatgaagctcagggacttacatgcttaggag  c.2887+1500

         .         .         .         .         .         .  g.40960
tttggatttcttatctctctaatacagcatttttcaaccttggtaattgtccgtgtgcgt  c.2887+1560

         .         .         .         .         .         .  g.41020
gggggtttcccctgtgcattttaggatattaaacagtatccctggtctctactcattaga  c.2887+1620

         .         .         .         .         .         .  g.41080
tgccaatactactgcctcagttataacaaacaaaaatgtctccagatgttgccagatgtc  c.2887+1680

         .         .         .         .         .         .  g.41140
ccctgtgggacaaaattttcctggttgacaactgccacactaatgcagaaccattaaaat  c.2887+1740

         .         .         .         .         .         .  g.41200
gggttagtggatgggttggttgttttagggaaatattcagtactgtttttgtaatgaacc  c.2887+1800

         .         .         .         .         .         .  g.41260
aggcttattttttaaaattctggtactgtggtaaattacaaaaattaaatttaaaaatca  c.2887+1860

         .         .         .         .         .         .  g.41320
tttaaaatcccaccatccagaaattttcaacctttgacaaatattttctagacatgctgg  c.2887+1920

         .         .         .         .         .         .  g.41380
aagattttaagggtacaggtttacatttagatatatcatttatatgtaacttgtagattt  c.2887+1980

         .         .         .         .         .         .  g.41440
aggtagctggtgagtggagtagagcaagtaattttaaccttctcttagcctcaattttcc  c.2887+2040

         .        g.41456
caaccctaaatcaggc  c.2887+2056

--------------------- middle of intron ---------------------
                                g.41457           .           g.41471
                                c.2888-2055  ctaatacccattagt  c.2888-2041

.         .         .         .         .         .           g.41531
ttaccctatttgggatggggcttggattaaataaataaaaacctcaaaggattctagaag  c.2888-1981

.         .         .         .         .         .           g.41591
gaattaaagagaagttatacatgaaagtgctttattaatttttaaagtactctgtgaatt  c.2888-1921

.         .         .         .         .         .           g.41651
taagatattgaccttcttggagtgataacctgtattagcccctccttatttgggagaaga  c.2888-1861

.         .         .         .         .         .           g.41711
ggagaattgggaagtggtgagatttttgttgactctataacaactccacactagctctcc  c.2888-1801

.         .         .         .         .         .           g.41771
aactcagtttttttgtttctgagatgctacttacaggctccacatttaggtaagtaaact  c.2888-1741

.         .         .         .         .         .           g.41831
gctttgataggaaaacatcaataattcatatttttcacatacattttgcaagctagttag  c.2888-1681

.         .         .         .         .         .           g.41891
tagttgctgtttattaaggtctgattttatgtcagatgtgcatcattgtattttagctta  c.2888-1621

.         .         .         .         .         .           g.41951
attttcacgggaactgtggaagctagcagacagtaccactacattataaatgaggaacct  c.2888-1561

.         .         .         .         .         .           g.42011
aggacttggaagattaagtgactttcttaaagccactcggtgagttggtggaagagtctg  c.2888-1501

.         .         .         .         .         .           g.42071
gatctcttcccaagtctgtctggattccagaactaggaatcttttctataaaccattgct  c.2888-1441

.         .         .         .         .         .           g.42131
gctttattcattaactctttagcaacaaaggcagttcattcttttgtgtaaagaaaaatt  c.2888-1381

.         .         .         .         .         .           g.42191
taggttgctgtatattggacagatgactttggaatggatcttatatttcacttactctgc  c.2888-1321

.         .         .         .         .         .           g.42251
aaatagagtaagcgatgggcatgcaacgatcacacagggaatggcactgacatgtggata  c.2888-1261

.         .         .         .         .         .           g.42311
gaagatgtaagaccaagtggatgtttattgggaacattgttcataactgtcacccttcta  c.2888-1201

.         .         .         .         .         .           g.42371
ttccgggagagggcagcatgtatctgttaagaagctgtagaatcataaagttgcattttt  c.2888-1141

.         .         .         .         .         .           g.42431
tttaatgtatgttacattccttaatatttaaaatgttcactggggccaggtgcggtggct  c.2888-1081

.         .         .         .         .         .           g.42491
cacgccggtaatcccagtgctttgggaggccaaggcaggcggatcatgaggtcaagagat  c.2888-1021

.         .         .         .         .         .           g.42551
cgagaccatcctggccaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagct  c.2888-961

.         .         .         .         .         .           g.42611
ggacgtggtggtgcgcacctgtagtcccagctatttgggaggctgaggcaggagaatctc  c.2888-901

.         .         .         .         .         .           g.42671
ttggacccaggaggcagaggttgcagtgagctgagatcgcaccactgcactccagcatgg  c.2888-841

.         .         .         .         .         .           g.42731
tgacagagcgagactccgtctcaaaaaaaaaaaatatattgttcattagaacaccattgc  c.2888-781

.         .         .         .         .         .           g.42791
agtttgggggaaaaggaagtaaatggtcgtgaaaacagatttgtgcttattaacaacatg  c.2888-721

.         .         .         .         .         .           g.42851
aaatgttacgttaggaactaatacgggaaaacattggtgtttcttatcctatcaatcttt  c.2888-661

.         .         .         .         .         .           g.42911
ataaattagcttagtatagacatagcattaaaaagaatattcaaatgattgtacttttct  c.2888-601

.         .         .         .         .         .           g.42971
ttagaggatagtagaaattgattgcaaaataatatagtaattcagcaatgaaataataaa  c.2888-541

.         .         .         .         .         .           g.43031
tccaaatttcatgtggctgatataaaataaccttcaaaggattctagtaaggaaaaataa  c.2888-481

.         .         .         .         .         .           g.43091
gttacaaccataaagaagcctatggatttaagagactgatttttttctttgaagttataa  c.2888-421

.         .         .         .         .         .           g.43151
cattttgttacctgaactggcttctttttttttttttttttttgtcctgagatggagtct  c.2888-361

.         .         .         .         .         .           g.43211
tgctctgtcacctaggctggagtgcagtggtgcaatctcaactcactgcaacttctgcct  c.2888-301

.         .         .         .         .         .           g.43271
caagggttcaagcaattctcccgcctcagcctcctgagtagctaggattacaggtgtgcg  c.2888-241

.         .         .         .         .         .           g.43331
ccaccatgcccggctaatttttttgtatttttagtagagacagggtttcaccatgttggc  c.2888-181

.         .         .         .         .         .           g.43391
cagactggtcttgaactcctgacctcgtgatctgcccacctcggcctcccaaagtgctgg  c.2888-121

.         .         .         .         .         .           g.43451
gattacaggcgtgagccaccacgcctggcctgaactggcttctaattggttggttaagta  c.2888-61

.         .         .         .         .         .           g.43511
agaagagattgaatgaaagacagactttcaattctaattcagatattcttttctacacag  c.2888-1


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