Python Module Index

c
 
c
cmind
    cmind.finders
    cmind.globals
    cmind.pipeline.ants_applywarp
    cmind.pipeline.ants_register
    cmind.pipeline.cmind_age_to_template
    cmind.pipeline.cmind_alpha
    cmind.pipeline.cmind_apply_normalization
    cmind.pipeline.cmind_atlas_to_subject
    cmind.pipeline.cmind_baselineCBF_coregisterT1
    cmind.pipeline.cmind_baselineCBF_preprocess
    cmind.pipeline.cmind_baselineCBF_quantitative
    cmind.pipeline.cmind_bias_correct
    cmind.pipeline.cmind_brain_extract
    cmind.pipeline.cmind_build_feat_dir
    cmind.pipeline.cmind_calculate_slice_coverage
    cmind.pipeline.cmind_crop_robust
    cmind.pipeline.cmind_DTI_HARDI_QA
    cmind.pipeline.cmind_DWI_TRK_to_3plane
    cmind.pipeline.cmind_fieldmap_process
    cmind.pipeline.cmind_fieldmap_regBBR
    cmind.pipeline.cmind_fMRI_level1_stats
    cmind.pipeline.cmind_fMRI_norm
    cmind.pipeline.cmind_fMRI_outliers
    cmind.pipeline.cmind_fMRI_preprocess
    cmind.pipeline.cmind_fMRI_preprocess2
    cmind.pipeline.cmind_normalize
    cmind.pipeline.cmind_rigid_coregister
    cmind.pipeline.cmind_segment
    cmind.pipeline.cmind_stage_second_level
    cmind.pipeline.cmind_struct_preprocess
    cmind.pipeline.cmind_T1_tissue_averages
    cmind.pipeline.cmind_T1map_fit
    cmind.pipeline.cmind_T1map_preprocess
    cmind.utils.cmind_HTML_report_gen
    cmind.utils.decorators
    cmind.utils.file_utils
    cmind.utils.fsf_utils
    cmind.utils.fsl_mcflirt_opt
    cmind.utils.fsl_mcflirt_opt_ASLBOLD
    cmind.utils.image_utils
    cmind.utils.logging_utils
    cmind.utils.nifti_utils
    cmind.utils.utils